The International Doctorate in Structural Biology är en internationell doktorsexamen i samarbete med universiteten i Frankfurt och Utrecht. Den etablerades med ett avtal som undertecknades av de tre rektorerna 2001. På basis av detta avtal anses doktorandtiteln som studenterna erhåller i slutet av programmet likvärdig med den som erhålls vid Bijvoet Centre for Biomolecular Research och med doktorandtiteln i kemi och biokemi från universitetet i Frankfurt.

Doktorandskolan i Atomic and Molecular Photonics föddes under inspiration av den avancerade multidisciplinära forskningen som bedrivs, sedan 1991, vid European Laboratory for Non Linear Spectroscopy (LENS) vid University of Florence .

Doktorandprogrammet (enligt italienska Dottorato di Ricerca) är en akademisk examen på forskarnivå. Det representerar genomförandet av den tredje utbildningscykeln för forskning (enligt Bolognaavtalet) i det italienska akademiska systemet och tillhandahåller de förmågor och kompetenser som krävs för att utföra högkvalificerad forskning vid universitet, offentliga institutioner och privata företag.

Doktorandprogrammet i utvecklingsekonomi och lokala system (DELoS) är ett nytt doktorandprogram som lanserades läsåret 2020-21 av University of Florence med fokus på utvecklingsekonomi och lokal utveckling. Ur innehållssynpunkt ligger fokus på analys av komplexa socioekonomiska system på mikro-, meso- och makronivå.

Ph.D. Programmet i hållbar förvaltning av jordbruksskogsbruk och livsmedelsresurser bygger på långvarig erfarenhet av forskning och undervisning vid Institutionen för jordbruk, livsmedel, miljö och skogsbruk (DAGRI) vid University of Florence .